Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Acvr1P37172 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acvr1P37172 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acvr1P37172 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms