Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Hoxa10P31310 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Hoxa10P31310 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hoxa10P31310 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms