Protein–RNA interactions for Protein: P30048

PRDX3, Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX3P30048 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRDX3P30048 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRDX3P30048 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRDX3P30048 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201.9 ms