Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sept4P28661 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sept4P28661 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sept4P28661 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sept4P28661 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sept4P28661 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.4 ms