Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Bmi1P25916 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Bmi1P25916 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms