Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf239P24399 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Znf239P24399 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms