Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fcer1aP20489 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fcer1aP20489 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms