Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RargP18911 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RargP18911 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RargP18911 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RargP18911 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RargP18911 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RargP18911 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RargP18911 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RargP18911 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RargP18911 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RargP18911 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RargP18911 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RargP18911 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RargP18911 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RargP18911 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RargP18911 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RargP18911 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RargP18911 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RargP18911 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms