Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pou4f1P17208 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms