Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Msh3P13705 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Msh3P13705 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.6 ms