Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BMP3P12645 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BMP3P12645 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BMP3P12645 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BMP3P12645 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BMP3P12645 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BMP3P12645 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BMP3P12645 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BMP3P12645 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BMP3P12645 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BMP3P12645 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
BMP3P12645 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BMP3P12645 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BMP3P12645 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BMP3P12645 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BMP3P12645 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BMP3P12645 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BMP3P12645 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BMP3P12645 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BMP3P12645 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BMP3P12645 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BMP3P12645 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BMP3P12645 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BMP3P12645 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BMP3P12645 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BMP3P12645 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BMP3P12645 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.2 ms