Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CHGAP10645 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CHGAP10645 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHGAP10645 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHGAP10645 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHGAP10645 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHGAP10645 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHGAP10645 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHGAP10645 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHGAP10645 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CHGAP10645 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHGAP10645 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHGAP10645 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHGAP10645 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHGAP10645 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHGAP10645 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHGAP10645 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CHGAP10645 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHGAP10645 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHGAP10645 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CHGAP10645 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHGAP10645 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHGAP10645 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHGAP10645 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHGAP10645 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHGAP10645 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHGAP10645 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHGAP10645 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHGAP10645 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CHGAP10645 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CHGAP10645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHGAP10645 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
CHGAP10645 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CHGAP10645 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.89
CHGAP10645 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
CHGAP10645 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms