Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00271P0C7V0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00271P0C7V0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00271P0C7V0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms