Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNRPAP09012 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPAP09012 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPAP09012 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173 ms