Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP3P08254 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP3P08254 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MMP3P08254 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MMP3P08254 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MMP3P08254 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MMP3P08254 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP3P08254 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP3P08254 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MMP3P08254 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MMP3P08254 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MMP3P08254 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MMP3P08254 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MMP3P08254 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MMP3P08254 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MMP3P08254 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MMP3P08254 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MMP3P08254 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms