Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RHOCP08134 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOCP08134 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOCP08134 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHOCP08134 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHOCP08134 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHOCP08134 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHOCP08134 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHOCP08134 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOCP08134 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHOCP08134 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHOCP08134 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOCP08134 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOCP08134 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOCP08134 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOCP08134 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOCP08134 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOCP08134 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOCP08134 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOCP08134 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHOCP08134 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOCP08134 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOCP08134 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHOCP08134 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOCP08134 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms