Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GJB1P08034 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GJB1P08034 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB1P08034 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB1P08034 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB1P08034 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GJB1P08034 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GJB1P08034 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GJB1P08034 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GJB1P08034 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GJB1P08034 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GJB1P08034 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GJB1P08034 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GJB1P08034 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms