Protein–RNA interactions for Protein: P05784

Krt18, Keratin, type I cytoskeletal 18, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt18P05784 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt18P05784 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt18P05784 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt18P05784 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt18P05784 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt18P05784 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt18P05784 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt18P05784 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt18P05784 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms