Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP1B1P05026 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP1B1P05026 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms