Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TNNC2P02585 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNC2P02585 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNC2P02585 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms