Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lamc1P02468 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Lamc1P02468 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lamc1P02468 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lamc1P02468 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms