Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAP4K4O95819 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAP4K4O95819 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAP4K4O95819 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms