Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GJB6O95452 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GJB6O95452 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GJB6O95452 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB6O95452 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB6O95452 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJB6O95452 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJB6O95452 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB6O95452 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB6O95452 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB6O95452 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB6O95452 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB6O95452 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB6O95452 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB6O95452 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB6O95452 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB6O95452 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB6O95452 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB6O95452 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB6O95452 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB6O95452 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB6O95452 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB6O95452 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms