Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCA5LO95447 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCA5LO95447 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCA5LO95447 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.9 ms