Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
JtbO88824 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
JtbO88824 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
JtbO88824 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
JtbO88824 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
JtbO88824 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
JtbO88824 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
JtbO88824 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
JtbO88824 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
JtbO88824 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
JtbO88824 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
JtbO88824 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.9 ms