Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tnnt1O88346 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tnnt1O88346 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnnt1O88346 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms