Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc4a4O88343 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc4a4O88343 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a4O88343 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms