Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sorl1O88307 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sorl1O88307 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sorl1O88307 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms