Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSO75390 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSO75390 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSO75390 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSO75390 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSO75390 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CSO75390 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CSO75390 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CSO75390 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CSO75390 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CSO75390 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CSO75390 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CSO75390 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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