Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CILPO75339 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CILPO75339 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CILPO75339 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CILPO75339 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CILPO75339 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CILPO75339 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CILPO75339 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CILPO75339 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CILPO75339 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CILPO75339 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CILPO75339 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CILPO75339 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CILPO75339 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CILPO75339 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CILPO75339 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CILPO75339 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CILPO75339 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CILPO75339 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CILPO75339 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CILPO75339 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CILPO75339 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CILPO75339 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CILPO75339 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CILPO75339 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms