Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Vamp4O70480 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vamp4O70480 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vamp4O70480 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms