Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTNSO60931 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTNSO60931 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTNSO60931 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTNSO60931 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTNSO60931 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTNSO60931 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNSO60931 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNSO60931 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTNSO60931 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTNSO60931 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTNSO60931 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTNSO60931 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms