Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Dsg2O55111 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dsg2O55111 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dsg2O55111 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms