Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
E2f6O54917 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
E2f6O54917 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2f6O54917 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms