Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITM2AO43736 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ITM2AO43736 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ITM2AO43736 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms