Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnf5O35445 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf5O35445 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms