Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-ObO35424 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-ObO35424 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms