Protein–RNA interactions for Protein: O35295

Purb, Transcriptional activator protein Pur-beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PurbO35295 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PurbO35295 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PurbO35295 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PurbO35295 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PurbO35295 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PurbO35295 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PurbO35295 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PurbO35295 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PurbO35295 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PurbO35295 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PurbO35295 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PurbO35295 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PurbO35295 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PurbO35295 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PurbO35295 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PurbO35295 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PurbO35295 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PurbO35295 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PurbO35295 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PurbO35295 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PurbO35295 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PurbO35295 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PurbO35295 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PurbO35295 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PurbO35295 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PurbO35295 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PurbO35295 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms