Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Scarb2O35114 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Scarb2O35114 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarb2O35114 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Scarb2O35114 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarb2O35114 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms