Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKBO14920 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IKBKBO14920 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
IKBKBO14920 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IKBKBO14920 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms