Protein–RNA interactions for Protein: O08917

Flot1, Flotillin-1, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flot1O08917 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Flot1O08917 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Flot1O08917 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms