Protein–RNA interactions for Protein: M0QW51

Gm17078, Predicted gene 17078, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17078M0QW51 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm17078M0QW51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm17078M0QW51 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms