Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lipo1J3QME6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lipo1J3QME6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lipo1J3QME6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms