Protein–RNA interactions for Protein: J3KMR8

Gm17535, Predicted gene, 17535, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17535J3KMR8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm17535J3KMR8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gm17535J3KMR8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gm17535J3KMR8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms