Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm20828J3KMI7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm20828J3KMI7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm20828J3KMI7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms