Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cldn34aG3UW52 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn34aG3UW52 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms