Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8220F6YKI2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8220F6YKI2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8220F6YKI2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms