Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
4933403O08RikF6UK53 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
4933403O08RikF6UK53 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933403O08RikF6UK53 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms