Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf212F6TQD1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf212F6TQD1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms