Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cdh18E9Q9Q6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Cdh18E9Q9Q6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cdh18E9Q9Q6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms